Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCNP55089 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UCNP55089 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UCNP55089 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UCNP55089 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UCNP55089 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UCNP55089 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCNP55089 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCNP55089 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCNP55089 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UCNP55089 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCNP55089 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCNP55089 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCNP55089 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCNP55089 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCNP55089 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UCNP55089 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCNP55089 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCNP55089 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCNP55089 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UCNP55089 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UCNP55089 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCNP55089 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCNP55089 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UCNP55089 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCNP55089 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UCNP55089 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms