Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 KTR5YNL029C 1569 nt5.63□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YGR127WYGR127W 939 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YMR295CYMR295C 594 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RRS1YOR294W 612 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 NME1NME1 340 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 PRY3YJL078C 2646 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YLL067CYLL067C 3618 nt5.62□□□□□ -1.51
SYF2P53277 AFG1YEL052W 1530 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YEL068CYEL068C 333 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RMD9YGL107C 1941 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YLR463CYLR463C 552 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YNL285WYNL285W 372 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RRP9YPR137W 1722 nt5.61□□□□□ -1.51
SYF2P53277 HVG1YER039C 750 nt5.6□□□□□ -1.51
SYF2P53277 SHO1YER118C 1104 nt5.6□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RPN11YFR004W 921 nt5.6□□□□□ -1.51
SYF2P53277 TSR3YOR006C 942 nt5.6□□□□□ -1.51
SYF2P53277 ESC8YOL017W 2145 nt5.6□□□□□ -1.51
SYF2P53277 FRS2YFL022C 1512 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 HAS1YMR290C 1518 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RPT3YDR394W 1287 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 TSA1YML028W 591 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 RPS28AYOR167C 204 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 YPR114WYPR114W 948 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 HIR1YBL008W 2523 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 MNN5YJL186W 1761 nt5.59□□□□□ -1.51
SYF2P53277 CIT3YPR001W 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 VHT1YGR065C 1782 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 HST3YOR025W 1344 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 JNM1YMR294W 1122 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MRPL10YNL284C 969 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YPR123CYPR123C 435 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YDR387CYDR387C 1668 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 PYC1YGL062W 3537 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 DSF1YEL070W 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YNR073CYNR073C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 PYK2YOR347C 1521 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ERG1YGR175C 1491 nt5.58□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MRC1YCL061C 3291 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ICL1YER065C 1674 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 NSE5YML023C 1671 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 PHB1YGR132C 864 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ERP2YAL007C 648 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YOL163WYOL163W 510 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ATG22YCL038C 1587 nt5.57□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YDR015CYDR015C 240 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 SRY1YKL218C 981 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 SCS7YMR272C 1155 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 VPS5YOR069W 2028 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 GYP8YFL027C 1494 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MPA43YNL249C 1629 nt5.56□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ATF1YOR377W 1578 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MKK1YOR231W 1527 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 BCY1YIL033C 1251 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 LDS1YAL018C 978 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YHM2YMR241W 945 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 GLN1YPR035W 1113 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YBR226CYBR226C 411 nt5.55□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ATG4YNL223W 1485 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 THI4YGR144W 981 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MRS1YIR021W 1092 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 RPE1YJL121C 717 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 CAF40YNL288W 1122 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MRPS16YPL013C 366 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 ATP4YPL078C 735 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MTC5YDR128W 3447 nt5.54□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YFL042CYFL042C 2025 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 YDL218WYDL218W 954 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 MRPS12YNR036C 462 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 VMA4YOR332W 702 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 CDC16YKL022C 2523 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 RAD3YER171W 2337 nt5.53□□□□□ -1.52
SYF2P53277 PKC1YBL105C 3456 nt5.52□□□□□ -1.53
SYF2P53277 QRI5YLR204W 336 nt5.52□□□□□ -1.53
SYF2P53277 RAD24YER173W 1980 nt5.52□□□□□ -1.53
SYF2P53277 MCM3YEL032W 2916 nt5.52□□□□□ -1.53
SYF2P53277 IVY1YDR229W 1362 nt5.52□□□□□ -1.53
SYF2P53277 DOT5YIL010W 648 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 TAL1YLR354C 1008 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 FSF1YOR271C 984 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 HXK2YGL253W 1461 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 CLB2YPR119W 1476 nt5.51□□□□□ -1.53
SYF2P53277 VPS4YPR173C 1314 nt5.5□□□□□ -1.53
SYF2P53277 XBP1YIL101C 1944 nt5.5□□□□□ -1.53
SYF2P53277 RPS5YJR123W 678 nt5.5□□□□□ -1.53
SYF2P53277 IFA38YBR159W 1044 nt5.5□□□□□ -1.53
SYF2P53277 MET8YBR213W 825 nt5.5□□□□□ -1.53
SYF2P53277 RPL7AYGL076C 735 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms