Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC1P48995 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRPC1P48995 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRPC1P48995 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms