Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PITPNBP48739 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITPNBP48739 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITPNBP48739 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms