Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA4P43358 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA4P43358 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms