Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 MRPS16YPL013C 366 nt5.15□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CBK1YNL161W 2271 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 PYC2YBR218C 3543 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 KKQ8YKL168C 2175 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YET3YDL072C 612 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 EFM3YJR129C 1020 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YHM2YMR241W 945 nt5.14□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YDR514CYDR514C 1452 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YEL068CYEL068C 333 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 HVG1YER039C 750 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 MSP1YGR028W 1089 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 DRE2YKR071C 1047 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 HAP3YBL021C 435 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CAF40YNL288W 1122 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RPN7YPR108W 1290 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 VPS4YPR173C 1314 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 VHT1YGR065C 1782 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YOL036WYOL036W 2286 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CNE1YAL058W 1509 nt5.13□□□□□ -1.59
CCS1P40202 KTR5YNL029C 1569 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 MPA43YNL249C 1629 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 HIS7YBR248C 1659 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RRP9YPR137W 1722 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YDR015CYDR015C 240 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CDC34YDR054C 888 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CCP1YKR066C 1086 nt5.12□□□□□ -1.59
CCS1P40202 MDM31YHR194W 1740 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 KEL1YHR158C 3495 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 PMP3YDR276C 168 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YMR295CYMR295C 594 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 MRPL10YNL284C 969 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YPR114WYPR114W 948 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RSA4YCR072C 1548 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 PDR18YNR070W 4002 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RGD1YBR260C 2001 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 CSC1YLR241W 2349 nt5.11□□□□□ -1.59
CCS1P40202 ICL1YER065C 1674 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 FRS2YFL022C 1512 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RPE1YJL121C 717 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 OAC1YKL120W 975 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YNR040WYNR040W 771 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 MCM3YEL032W 2916 nt5.1□□□□□ -1.59
CCS1P40202 YEL020CYEL020C 1683 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 RPS28AYOR167C 204 nt5.09□□□□□ -1.59
CCS1P40202 UTP4YDR324C 2331 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 PYK2YOR347C 1521 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YDL218WYDL218W 954 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 SRY1YKL218C 981 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 VMA4YOR332W 702 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 HXT17YNR072W 1695 nt5.08□□□□□ -1.6
CCS1P40202 DSF1YEL070W 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YNR073CYNR073C 1509 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 ATG4YNL223W 1485 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 SKN1YGR143W 2316 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RNH201YNL072W 924 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RMD9YGL107C 1941 nt5.07□□□□□ -1.6
CCS1P40202 MRC1YCL061C 3291 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 VPS5YOR069W 2028 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YIL077CYIL077C 963 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YNL285WYNL285W 372 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 FSF1YOR271C 984 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 GAT1YFL021W 1533 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 PAT1YCR077C 2391 nt5.06□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RPN11YFR004W 921 nt5.05□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YJU3YKL094W 942 nt5.05□□□□□ -1.6
CCS1P40202 STB5YHR178W 2232 nt5.05□□□□□ -1.6
CCS1P40202 TIM22YDL217C 624 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 HAP2YGL237C 798 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YHL018WYHL018W 363 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RPL10YLR075W 666 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YLR463CYLR463C 552 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 JNM1YMR294W 1122 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RAD24YER173W 1980 nt5.04□□□□□ -1.6
CCS1P40202 RAD3YER171W 2337 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 QNS1YHR074W 2145 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YDR387CYDR387C 1668 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YER186CYER186C 921 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YJR154WYJR154W 1041 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 YML018CYML018C 1182 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 EMW1YNL313C 2715 nt5.03□□□□□ -1.6
CCS1P40202 TRP5YGL026C 2124 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 YDL129WYDL129W 876 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 RPL7AYGL076C 735 nt5.02□□□□□ -1.61
CCS1P40202 RPS5YJR123W 678 nt5.02□□□□□ -1.61
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