Protein–RNA interactions for Protein: P38708

YHR020W, Putative proline--tRNA ligase YHR020W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR020WP38708 YOL024WYOL024W 519 nt6.79□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 PHO85YPL031C 918 nt6.79□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YDR514CYDR514C 1452 nt6.79□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 MHP1YJL042W 4197 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 GLN3YER040W 2193 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 CTA1YDR256C 1548 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YDL121CYDL121C 450 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 IRC7YFR055W 1023 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YKL169CYKL169C 384 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 PUS4YNL292W 1212 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YOL099CYOL099C 492 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 RRP40YOL142W 723 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YPR109WYPR109W 885 nt6.78□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 YJL163CYJL163C 1668 nt6.77□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 PAF1YBR279W 1338 nt6.77□□□□□ -1.32
YHR020WP38708 BIO3YNR058W 1443 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 RIX7YLL034C 2514 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 HPT1YDR399W 666 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 PEX22YAL055W 543 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YOL046CYOL046C 675 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 ERG10YPL028W 1197 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 APE4YHR113W 1473 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 GIT1YCR098C 1557 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 PLB3YOL011W 2061 nt6.77□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 MPH3YJR160C 1809 nt6.76□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YAL045CYAL045C 309 nt6.76□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YKR073CYKR073C 321 nt6.76□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 LDB7YBL006C 543 nt6.76□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YPR127WYPR127W 1038 nt6.76□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 SLD2YKL108W 1362 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 MAF1YDR005C 1188 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 DIN7YDR263C 1293 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 ERV14YGL054C 417 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YJR056CYJR056C 711 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 LOT6YLR011W 576 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YNL200CYNL200C 741 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 HRT1YOL133W 366 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YPR076WYPR076W 375 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 FRE7YOL152W 1863 nt6.75□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 URA7YBL039C 1740 nt6.74□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 RPC19YNL113W 429 nt6.74□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 SLX5YDL013W 1860 nt6.74□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 CYS4YGR155W 1524 nt6.74□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 CRP1YHR146W 1398 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YMR155WYMR155W 1644 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 AVT4YNL101W 2142 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 RMD5YDR255C 1266 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 SNF4YGL115W 969 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 ATP12YJL180C 978 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 FIT2YOR382W 462 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 HXT17YNR072W 1695 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 CYC8YBR112C 2901 nt6.73□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 IRC5YFR038W 2562 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 DLD1YDL174C 1764 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 AGX1YFL030W 1158 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 HEM2YGL040C 1029 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YGL101WYGL101W 648 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YGR011WYGR011W 327 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YJR107WYJR107W 987 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 FCY22YER060W-A 1593 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 GIP2YER054C 1647 nt6.72□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 PXL1YKR090W 2121 nt6.71□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 DDC1YPL194W 1839 nt6.71□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 YLH47YPR125W 1365 nt6.71□□□□□ -1.33
YHR020WP38708 MSS1YMR023C 1581 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YDL241WYDL241W 372 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 SPC34YKR037C 888 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 CTR3YLR411W 726 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YBL029WYBL029W 1131 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 DOM34YNL001W 1161 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 PFA4YOL003C 1137 nt6.71□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 CHL4YDR254W 1377 nt6.7□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HIS7YBR248C 1659 nt6.7□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HXT3YDR345C 1704 nt6.7□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 IVY1YDR229W 1362 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YCR041WYCR041W 333 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 PPH21YDL134C 1110 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HST4YDR191W 1113 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 REC107YJR021C 945 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 PSR1YLL010C 1284 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 SFT2YBL102W 648 nt6.69□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 TDP1YBR223C 1635 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 MSG5YNL053W 1470 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 PYK2YOR347C 1521 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 PFA5YDR459C 1125 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YGL102CYGL102C 429 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 CTF8YHR191C 402 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 MHO1YJR008W 1017 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HOC1YJR075W 1191 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 VMS1YDR049W 1899 nt6.68□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HXT7YDR342C 1713 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 HXT6YDR343C 1713 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 VPS36YLR417W 1701 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 COX15YER141W 1461 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 CEF1YMR213W 1773 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 UGO1YDR470C 1509 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YGL072CYGL072C 360 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YHR095WYHR095W 495 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YJL215CYJL215C 360 nt6.67□□□□□ -1.34
YHR020WP38708 YLL056CYLL056C 897 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.5 ms