Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCK1P35558 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCK1P35558 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCK1P35558 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCK1P35558 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCK1P35558 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCK1P35558 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCK1P35558 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCK1P35558 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCK1P35558 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCK1P35558 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCK1P35558 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCK1P35558 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCK1P35558 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCK1P35558 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCK1P35558 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCK1P35558 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCK1P35558 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCK1P35558 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCK1P35558 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCK1P35558 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCK1P35558 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCK1P35558 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCK1P35558 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCK1P35558 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCK1P35558 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCK1P35558 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCK1P35558 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCK1P35558 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCK1P35558 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCK1P35558 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCK1P35558 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCK1P35558 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCK1P35558 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCK1P35558 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCK1P35558 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCK1P35558 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCK1P35558 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCK1P35558 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCK1P35558 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCK1P35558 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCK1P35558 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms