Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCKSP29966 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCKSP29966 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCKSP29966 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms