Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABRB3P28472 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABRB3P28472 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms