Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6KB1P23443 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPS6KB1P23443 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RPS6KB1P23443 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms