Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD247P20963 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD247P20963 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD247P20963 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD247P20963 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD247P20963 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD247P20963 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD247P20963 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD247P20963 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD247P20963 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD247P20963 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD247P20963 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD247P20963 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD247P20963 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD247P20963 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD247P20963 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD247P20963 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD247P20963 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD247P20963 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD247P20963 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD247P20963 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD247P20963 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD247P20963 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD247P20963 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD247P20963 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD247P20963 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD247P20963 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD247P20963 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD247P20963 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD247P20963 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD247P20963 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms