Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPN3P20807 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN3P20807 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms