Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD53P19397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD53P19397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD53P19397 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CD53P19397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CD53P19397 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CD53P19397 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CD53P19397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD53P19397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD53P19397 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CD53P19397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD53P19397 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD53P19397 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD53P19397 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD53P19397 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD53P19397 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CD53P19397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD53P19397 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD53P19397 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD53P19397 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CD53P19397 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD53P19397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD53P19397 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD53P19397 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD53P19397 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD53P19397 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD53P19397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD53P19397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD53P19397 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms