Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH2P19022 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH2P19022 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH2P19022 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH2P19022 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH2P19022 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH2P19022 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH2P19022 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH2P19022 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH2P19022 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH2P19022 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH2P19022 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH2P19022 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH2P19022 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH2P19022 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH2P19022 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH2P19022 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH2P19022 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH2P19022 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH2P19022 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH2P19022 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH2P19022 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH2P19022 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH2P19022 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH2P19022 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH2P19022 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH2P19022 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH2P19022 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH2P19022 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH2P19022 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH2P19022 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH2P19022 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms