Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL7RP16871 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL7RP16871 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IL7RP16871 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IL7RP16871 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IL7RP16871 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
IL7RP16871 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL7RP16871 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL7RP16871 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IL7RP16871 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IL7RP16871 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IL7RP16871 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IL7RP16871 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL7RP16871 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IL7RP16871 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL7RP16871 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL7RP16871 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IL7RP16871 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IL7RP16871 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IL7RP16871 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IL7RP16871 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IL7RP16871 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IL7RP16871 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms