Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MYOD1P15172 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MYOD1P15172 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms