Protein–RNA interactions for Protein: P0CAT3

TLX1NB, Putative TLX1 neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX1NBP0CAT3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TLX1NBP0CAT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX1NBP0CAT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms