Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CALB1P05937 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CALB1P05937 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB1P05937 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB1P05937 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB1P05937 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CALB1P05937 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CALB1P05937 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB1P05937 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB1P05937 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALB1P05937 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALB1P05937 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CALB1P05937 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALB1P05937 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB1P05937 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB1P05937 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB1P05937 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALB1P05937 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB1P05937 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALB1P05937 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB1P05937 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB1P05937 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB1P05937 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CALB1P05937 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CALB1P05937 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB1P05937 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB1P05937 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB1P05937 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CALB1P05937 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CALB1P05937 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALB1P05937 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CALB1P05937 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALB1P05937 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALB1P05937 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALB1P05937 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALB1P05937 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CALB1P05937 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CALB1P05937 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CALB1P05937 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms