Protein–RNA interactions for Protein: P03928

MT-ATP8, ATP synthase protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ATP8P03928 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MT-ATP8P03928 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MT-ATP8P03928 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MT-ATP8P03928 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms