Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRD1O95696 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRD1O95696 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRD1O95696 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRD1O95696 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD1O95696 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD1O95696 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRD1O95696 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRD1O95696 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD1O95696 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD1O95696 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD1O95696 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRD1O95696 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD1O95696 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD1O95696 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD1O95696 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRD1O95696 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRD1O95696 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD1O95696 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD1O95696 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD1O95696 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRD1O95696 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD1O95696 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD1O95696 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD1O95696 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRD1O95696 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD1O95696 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD1O95696 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD1O95696 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRD1O95696 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRD1O95696 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD1O95696 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD1O95696 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD1O95696 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD1O95696 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRD1O95696 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD1O95696 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD1O95696 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD1O95696 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD1O95696 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD1O95696 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms