Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STAMBPO95630 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAMBPO95630 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STAMBPO95630 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms