Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CBX6O95503 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX6O95503 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX6O95503 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX6O95503 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX6O95503 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CBX6O95503 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CBX6O95503 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX6O95503 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX6O95503 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX6O95503 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX6O95503 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX6O95503 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX6O95503 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX6O95503 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX6O95503 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX6O95503 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX6O95503 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX6O95503 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX6O95503 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX6O95503 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX6O95503 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX6O95503 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX6O95503 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX6O95503 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX6O95503 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX6O95503 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms