Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC31AO94979 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC31AO94979 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms