Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR47O94967 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR47O94967 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR47O94967 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR47O94967 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR47O94967 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR47O94967 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR47O94967 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR47O94967 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR47O94967 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR47O94967 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR47O94967 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR47O94967 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR47O94967 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR47O94967 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR47O94967 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR47O94967 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR47O94967 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR47O94967 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR47O94967 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR47O94967 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR47O94967 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR47O94967 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR47O94967 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR47O94967 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR47O94967 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR47O94967 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR47O94967 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR47O94967 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR47O94967 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR47O94967 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR47O94967 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR47O94967 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR47O94967 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR47O94967 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR47O94967 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR47O94967 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR47O94967 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR47O94967 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms