Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF40AO75400 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRPF40AO75400 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF40AO75400 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF40AO75400 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms