Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL41O60662 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL41O60662 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL41O60662 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL41O60662 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms