Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
ATP10AO60312 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ATP10AO60312 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
ATP10AO60312 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ATP10AO60312 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ATP10AO60312 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335.7 ms