Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF4O43474 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF4O43474 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLF4O43474 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF4O43474 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF4O43474 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF4O43474 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF4O43474 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF4O43474 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF4O43474 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF4O43474 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF4O43474 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF4O43474 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF4O43474 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF4O43474 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF4O43474 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF4O43474 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF4O43474 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLF4O43474 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF4O43474 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF4O43474 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF4O43474 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF4O43474 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF4O43474 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF4O43474 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF4O43474 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF4O43474 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF4O43474 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF4O43474 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF4O43474 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF4O43474 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF4O43474 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF4O43474 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms