Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CBFA2T2O43439 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBFA2T2O43439 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBFA2T2O43439 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms