Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA4O00629 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA4O00629 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPNA4O00629 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms