Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFRSF11BO00300 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF11BO00300 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF11BO00300 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF11BO00300 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF11BO00300 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms