Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49D1C9J1S8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49D1C9J1S8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM49D1C9J1S8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM49D1C9J1S8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM49D1C9J1S8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM49D1C9J1S8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms