Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM23A6NLE4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM23A6NLE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM23A6NLE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms