Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6BA6NDN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6BA6NDN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms