Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC66A2RUB6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC66A2RUB6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC66A2RUB6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms