Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf170A2RU37 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf170A2RU37 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C9orf170A2RU37 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms