Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRGMA1A4Y4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRGMA1A4Y4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRGMA1A4Y4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms