Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPAARA0A1B0GVQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPAARA0A1B0GVQ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 677.6 ms