Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms