Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms