Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SNX13Q9Y5W8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX13Q9Y5W8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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