Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
L1RE1Q9UN81 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
L1RE1Q9UN81 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms