Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms