Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRTO4Q9UKD2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms