Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms