Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCSK1NQ9UHG2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PCSK1NQ9UHG2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms