Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP35Q9P2H5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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