Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHPF2Q9P2E5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms