Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCMF1Q9P0J7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCMF1Q9P0J7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms